More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1904 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  100 
 
 
400 aa  806    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  51.5 
 
 
409 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  53.11 
 
 
408 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  51.3 
 
 
407 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  48.15 
 
 
405 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  48.5 
 
 
406 aa  363  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  50.92 
 
 
395 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  46.58 
 
 
408 aa  342  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  49.08 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  43.35 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  46.19 
 
 
401 aa  334  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  43.87 
 
 
409 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  45 
 
 
403 aa  325  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  45.25 
 
 
398 aa  322  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  44.06 
 
 
404 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  44.96 
 
 
407 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  45.89 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  43.86 
 
 
408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  44.2 
 
 
412 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  44.2 
 
 
412 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  44.47 
 
 
405 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  44.67 
 
 
410 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  43.94 
 
 
412 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  45.82 
 
 
410 aa  312  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  44.13 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  43.01 
 
 
409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  44.56 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  43.54 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  42.75 
 
 
430 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  43.85 
 
 
421 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  46.63 
 
 
357 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  43.97 
 
 
400 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  42.03 
 
 
399 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  41.69 
 
 
407 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  41.69 
 
 
407 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  42.17 
 
 
400 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  40.77 
 
 
424 aa  289  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  44.04 
 
 
399 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  43.43 
 
 
404 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  42.36 
 
 
436 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  43.69 
 
 
398 aa  285  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  41.01 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  41.01 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  41.01 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  41.28 
 
 
409 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  41.11 
 
 
407 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  43.41 
 
 
406 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  43.41 
 
 
406 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  43.41 
 
 
406 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  41.99 
 
 
402 aa  276  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  42.75 
 
 
406 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  41.27 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  40.73 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  42.52 
 
 
400 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  41.34 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  39.28 
 
 
400 aa  269  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  39.12 
 
 
397 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  39.95 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  37.66 
 
 
415 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  42.69 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  40.5 
 
 
394 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.87 
 
 
405 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.52 
 
 
411 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.04 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  38.92 
 
 
404 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.21 
 
 
401 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  37.37 
 
 
415 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  40.1 
 
 
395 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  37.82 
 
 
411 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  37.05 
 
 
407 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  36.88 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.43 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.82 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  41.3 
 
 
398 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.11 
 
 
412 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.92 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  38.85 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  36.19 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  38.98 
 
 
423 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  38.5 
 
 
397 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  39.49 
 
 
404 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.79 
 
 
406 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  38.46 
 
 
375 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.9 
 
 
395 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  39.53 
 
 
403 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.63 
 
 
419 aa  232  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  37.68 
 
 
405 aa  229  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.57 
 
 
391 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  37.82 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.85 
 
 
411 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  35.92 
 
 
402 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.07 
 
 
398 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.86 
 
 
395 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.86 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.99 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.65 
 
 
411 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  33.08 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.55 
 
 
400 aa  219  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.85 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>