More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0519 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  100 
 
 		 347 aa  695    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  48.12 
 
 		 368 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  47.83 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  47.54 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  48.21 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  48.51 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  46.63 
 
 		 368 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  47.25 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  47.55 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  56.73 
 
 		 296 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  45.07 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  44.48 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  44.48 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  44.18 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  42.99 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  43.85 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 357 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  44.28 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  36.84 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  46.67 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  34.57 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  54.88 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  43.2 
 
 		 303 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  31.66 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  42.58 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  33.86 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  41.15 
 
 		 235 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  46.95 
 
 		 173 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  32.14 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  29.97 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  48.39 
 
 		 214 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  31.51 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  28.45 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  42.68 
 
 		 185 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  47.45 
 
 		 143 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  46.48 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  45.51 
 
 		 189 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  29.86 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  33.52 
 
 		 197 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  33.52 
 
 		 181 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  43.8 
 
 		 161 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  44.86 
 
 		 147 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  43.51 
 
 		 130 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  23.49 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  34.57 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  46.91 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  31.29 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  46.51 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  45 
 
 		 133 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  54.05 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  34.35 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  34.35 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  28.04 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  25.33 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  23.55 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  45.07 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  36.21 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  30.04 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  45.35 
 
 		 94 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  46.25 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0535  hypothetical protein  54.35 
 
 		 121 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  23.33 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  23.33 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  26.15 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  24.78 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  24.78 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  24.78 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  24.78 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  24.78 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  25.91 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  23.86 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  23.81 
 
 		 280 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2092  IS1404 transposase  24.05 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.702251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  23.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  26.58 
 
 		 282 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  24.02 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  24.02 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  24.02 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  20.7 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  20.7 
 
 		 282 aa  53.1  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  24.89 
 
 		 276 aa  52.8  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 289 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 289 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 289 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 289 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  24.89 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  24.89 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>