76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3634 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  256  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  57.76 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  55.17 
 
 		 119 aa  139  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  51.72 
 
 		 118 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  54.78 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  54.78 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  51.3 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  53.04 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  52.17 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  52.17 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  52.17 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  52.17 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  52.17 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  52.17 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  50.86 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  50.86 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  49.57 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  49.57 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  51.26 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  47.83 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  46.09 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  44.83 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  46.22 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  45.38 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  45.3 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  43.59 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  42.37 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  42.74 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  44.07 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  41.53 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  42.74 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  41.88 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  42.74 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  42.74 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  39.02 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  37.29 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  42.74 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  45.16 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  40.52 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  34.45 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  48 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  43.33 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  41.77 
 
 		 77 aa  67  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  35.44 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  37.66 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  41.77 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  32.1 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  38.46 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  41.25 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  36.84 
 
 		 78 aa  50.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  30.26 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  27.78 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  28.38 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  32.47 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  29.67 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  29.49 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.12 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  34.62 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  32 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  31.4 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  31.88 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  28 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  29.82 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  30.38 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  30.38 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  33.73 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.46 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  32.05 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  30.26 
 
 		 84 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>