288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3302 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 353 aa  719    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  46.09 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  43.81 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  38.11 
 
 		 393 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  37.46 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  36.6 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  39.13 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.14 
 
 		 446 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  34.15 
 
 		 449 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  37.2 
 
 		 455 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  34.15 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  34.34 
 
 		 419 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.74 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.87 
 
 		 543 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  32.96 
 
 		 451 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.7 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.74 
 
 		 474 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  33.5 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  35.05 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.47 
 
 		 468 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 		 461 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 		 461 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  33.68 
 
 		 454 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  35.12 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  33.78 
 
 		 540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.51 
 
 		 540 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.51 
 
 		 540 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.51 
 
 		 540 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.51 
 
 		 540 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.51 
 
 		 540 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  33.51 
 
 		 540 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  34.51 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  33.97 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  31.64 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  31.81 
 
 		 473 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  29.82 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  31.81 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  31.81 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  32.17 
 
 		 472 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  31.89 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  31.98 
 
 		 449 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  31.42 
 
 		 472 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.85 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  37.09 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  33.53 
 
 		 491 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  33.7 
 
 		 468 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.45 
 
 		 536 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 		 471 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  31.59 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.68 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.68 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  30.96 
 
 		 525 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.68 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.37 
 
 		 540 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  30.96 
 
 		 473 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  29.98 
 
 		 454 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.81 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.81 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.15 
 
 		 374 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.15 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.15 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.15 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 		 461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  32.73 
 
 		 449 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  32.73 
 
 		 449 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  33.7 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.89 
 
 		 433 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 		 435 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.19 
 
 		 476 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 		 449 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  33.7 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 		 461 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  31.98 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.53 
 
 		 487 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.03 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.1 
 
 		 768 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  32.5 
 
 		 626 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  34.72 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  35.29 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.94 
 
 		 431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  33.63 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  33.93 
 
 		 437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.15 
 
 		 462 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  32.84 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.77 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  31.59 
 
 		 594 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  31.16 
 
 		 417 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  31.76 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.13 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  29 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  29.52 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  32.84 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  32.84 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  32.84 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>