More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2787 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  100 
 
 		 305 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  48.12 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  47.87 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2333  ApbE family lipoprotein  46 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00261528  normal  0.177607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  44.88 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  45.23 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  44.88 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  44.88 
 
 		 301 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  44.3 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  44.01 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  44.01 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  43.97 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  43.46 
 
 		 275 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  41.99 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  42.11 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  41.55 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  40.13 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  43 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  40.97 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  39.86 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  37.71 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  39.93 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  39.44 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.96 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  33.46 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 349 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  31.84 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  31.45 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 		 345 aa  123  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  32.05 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.8 
 
 		 363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  29.67 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.6 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.29 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  30.37 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  30.4 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  29.23 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  29.51 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.86 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  28.63 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 328 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.76 
 
 		 350 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  26.39 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  30.56 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  26.69 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.21 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  30.13 
 
 		 380 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0092  ApbE family lipoprotein  30.98 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.1 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  28.63 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  30.8 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  29.84 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  28.31 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  30.65 
 
 		 345 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.96 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  29.07 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  29.07 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.07 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  29.39 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  28.24 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  26.28 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.15 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.27 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  26.91 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  31.14 
 
 		 346 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  31.14 
 
 		 346 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.94 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  28.84 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.06 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  26.74 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  25.35 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  28.33 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  29.72 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  29.62 
 
 		 344 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  25.08 
 
 		 362 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 348 aa  96.3  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  27.24 
 
 		 382 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.13 
 
 		 337 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 		 326 aa  95.5  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.72 
 
 		 367 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  31.2 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  23.97 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  29.96 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  23.97 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  23.97 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  23.97 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.8 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  23.29 
 
 		 374 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  23.29 
 
 		 374 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  26.27 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>