88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0520 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  601  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  58.19 
 
 		 288 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  50.36 
 
 		 297 aa  311  6.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  50.53 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  34.8 
 
 		 291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  30.38 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  27.56 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  29.63 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  29.84 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  28.67 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  29.92 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  27.62 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  28.26 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  28.27 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  26.5 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  27.84 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  26.67 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  26.67 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  26.32 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  29.63 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  25.96 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  28.83 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  26.88 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  26.76 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  26.26 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  26.76 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.44 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  27.44 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  27.44 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  27.44 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  27.44 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  27.44 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  27.44 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  27.43 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  29.3 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  28.83 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  26.86 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  25.98 
 
 		 330 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  24.8 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  26.04 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  27.4 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  27.4 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  27.99 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  28.77 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  28.77 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  26.19 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  26.79 
 
 		 473 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  27.82 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  28.09 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  26.04 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  28.25 
 
 		 417 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 300 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  27.82 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 348 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  24.22 
 
 		 357 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  27.34 
 
 		 336 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  27.34 
 
 		 336 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  27.34 
 
 		 336 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  27.34 
 
 		 336 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  26.15 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  25.6 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  25.69 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  25.6 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  25.44 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  21.21 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  29.57 
 
 		 308 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  31.25 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  26.45 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  29.2 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  26.92 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  27.68 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  32.03 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  26.56 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2835  hypothetical protein  31.86 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0510204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 473 aa  42.4  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>