217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2495 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
327 aa  652    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  96.94 
 
 
327 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  37.34 
 
 
310 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
354 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 
463 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  22.11 
 
 
614 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  31.21 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  31.21 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21121  hydrolase or acyltransferase  36.13 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.556966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  22.85 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  21.62 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  22.73 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  30.5 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  37.98 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  37.98 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  37.21 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  37.21 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  37.21 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  35.71 
 
 
246 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  24.86 
 
 
323 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
522 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  27.21 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  27.76 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  27.34 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  27.21 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1774  hypothetical protein  27.66 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  29.6 
 
 
571 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  34.13 
 
 
145 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
304 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
454 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  30.15 
 
 
320 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
364 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.1 
 
 
264 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  26.47 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2660  hypothetical protein  21.19 
 
 
479 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  39.19 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3345  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
262 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  20.86 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  29.82 
 
 
549 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  22.37 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
322 aa  52.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
252 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7767  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  22.41 
 
 
392 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1136  hypothetical protein  31.82 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5140  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
437 aa  50.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  21.03 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0128  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  25 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
338 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.29 
 
 
278 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  33.77 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  32.91 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  20.35 
 
 
350 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  22.05 
 
 
278 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
277 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>