67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02490 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM02490  translational initiation-related protein, putative  100 
 
 
1502 aa  3066    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80259  accessory factor to EIF3  27.12 
 
 
1242 aa  363  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0940196 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04908  eukaryotic translation initiation factor 3 subunit CLU1/TIF31, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10800)  33.78 
 
 
1130 aa  351  7e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43732  predicted protein  23.16 
 
 
1504 aa  206  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.576008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 
1424 aa  80.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 
1186 aa  75.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.02 
 
 
1404 aa  71.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
751 aa  70.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.69 
 
 
1039 aa  65.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.65 
 
 
825 aa  65.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
814 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1105 aa  63.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.12 
 
 
1228 aa  63.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.08 
 
 
2145 aa  62.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
284 aa  62  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
949 aa  60.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
924 aa  59.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
1215 aa  59.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 
885 aa  59.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 
568 aa  59.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
568 aa  59.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.28 
 
 
493 aa  58.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 
843 aa  57  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.86 
 
 
667 aa  56.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
857 aa  56.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.29 
 
 
767 aa  55.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6656  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 
979 aa  55.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
1028 aa  54.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  26.27 
 
 
1106 aa  54.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  21.22 
 
 
807 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  26.88 
 
 
311 aa  54.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
953 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  22.12 
 
 
836 aa  53.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.82 
 
 
1550 aa  53.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  23.75 
 
 
1509 aa  53.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1290 aa  53.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.8 
 
 
1328 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
454 aa  52.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
481 aa  52.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  29.25 
 
 
1383 aa  51.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  24.38 
 
 
1068 aa  51.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 
1288 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 
1050 aa  51.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.59 
 
 
854 aa  50.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
900 aa  50.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  23.86 
 
 
1429 aa  50.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
966 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 
1262 aa  49.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  20.1 
 
 
2413 aa  49.7  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 
725 aa  49.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.78 
 
 
1036 aa  49.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 
771 aa  49.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25 
 
 
732 aa  48.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  21.53 
 
 
694 aa  48.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  26.35 
 
 
1056 aa  48.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  23.78 
 
 
838 aa  47.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25.74 
 
 
919 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
669 aa  47.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
1088 aa  46.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  24.9 
 
 
977 aa  47  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.01 
 
 
1507 aa  46.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
1128 aa  46.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  22.92 
 
 
801 aa  46.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  30.11 
 
 
680 aa  45.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
911 aa  45.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
785 aa  45.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  27.93 
 
 
713 aa  45.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>