More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2912 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  231  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  83.5 
 
 		 107 aa  192  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  82.86 
 
 		 107 aa  189  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  82.52 
 
 		 107 aa  188  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  81.55 
 
 		 107 aa  187  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  74.76 
 
 		 108 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 106 aa  130  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  56.12 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  53.77 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  51.02 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 104 aa  87.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  35.79 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  31.63 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  32.98 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.25 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>