285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2124 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 513 aa  1054    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  57.31 
 
 		 512 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  57.31 
 
 		 506 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  56.49 
 
 		 511 aa  578  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  55.65 
 
 		 502 aa  577  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  54.69 
 
 		 509 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  38.78 
 
 		 508 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  34.98 
 
 		 523 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  37.74 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  34.65 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  36.07 
 
 		 498 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  36.42 
 
 		 504 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  36.42 
 
 		 504 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.86 
 
 		 507 aa  300  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  36.9 
 
 		 533 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  39.69 
 
 		 535 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  35.14 
 
 		 505 aa  293  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  35.36 
 
 		 505 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  34.27 
 
 		 507 aa  289  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  35.58 
 
 		 516 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  35.98 
 
 		 511 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  34.39 
 
 		 505 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  34.39 
 
 		 505 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  35.79 
 
 		 504 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 		 505 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  34.17 
 
 		 521 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  33.97 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  33.97 
 
 		 505 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  33.97 
 
 		 505 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  33.97 
 
 		 505 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  35.08 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  35.08 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  36.03 
 
 		 520 aa  279  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  34.34 
 
 		 509 aa  279  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  34.5 
 
 		 521 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  35.33 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  36.13 
 
 		 715 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  35.18 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  33.66 
 
 		 517 aa  277  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  32.25 
 
 		 520 aa  276  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  34.11 
 
 		 524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  35.53 
 
 		 520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  34.31 
 
 		 532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  31.91 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  34.31 
 
 		 532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  32.56 
 
 		 531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  33.14 
 
 		 531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  34.11 
 
 		 524 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  34.95 
 
 		 540 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  35.12 
 
 		 518 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  34.75 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  33.91 
 
 		 524 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  33.91 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  32.3 
 
 		 540 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  33.95 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  36.62 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  34.89 
 
 		 516 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  35.93 
 
 		 499 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  35.07 
 
 		 507 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  33.91 
 
 		 524 aa  269  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  34.76 
 
 		 519 aa  269  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  36.54 
 
 		 528 aa  269  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  35.51 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  34.17 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  31.51 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  32.62 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  35.25 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  35 
 
 		 519 aa  266  5e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  34.87 
 
 		 506 aa  266  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 515 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  33.19 
 
 		 506 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  32.9 
 
 		 514 aa  266  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 506 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 506 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 506 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 510 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  33.47 
 
 		 515 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 514 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  33.48 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  33.55 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  35.24 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  32.39 
 
 		 538 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  32.29 
 
 		 507 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  32.89 
 
 		 517 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  33.13 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 509 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  33.92 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  34.65 
 
 		 518 aa  259  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  33.12 
 
 		 510 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 513 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  33.92 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  32.44 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  33.69 
 
 		 533 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>