177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1562 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
259 aa  539  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  62.11 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  49.4 
 
 
254 aa  255  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  48.03 
 
 
257 aa  251  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  44.88 
 
 
255 aa  235  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  37.99 
 
 
266 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  39.83 
 
 
241 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.93 
 
 
853 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
750 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.95 
 
 
853 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 
853 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  40.55 
 
 
293 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.31 
 
 
851 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.31 
 
 
851 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.31 
 
 
851 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  32.31 
 
 
851 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.31 
 
 
851 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  33.47 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  30.08 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  31.2 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 
461 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  28.8 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  30.21 
 
 
868 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  48.98 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  51.02 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  38.03 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  35.05 
 
 
238 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
710 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 
201 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  40.98 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  30.25 
 
 
230 aa  52  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
711 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  23.61 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  42.59 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  52.27 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  50 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  50 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  50 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  44 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
231 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  36.92 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
324 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  42.19 
 
 
191 aa  48.9  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  36.67 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.16 
 
 
258 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  46.15 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  47.73 
 
 
168 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  47.73 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
331 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  47.73 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  38.67 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  48.78 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  43.14 
 
 
261 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  44.68 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
206 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
194 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  27.1 
 
 
240 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40 
 
 
345 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  47.06 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
293 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
211 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.18 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.53 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.38 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.58 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  35 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.9 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  43.18 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  43.75 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  40 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  44.68 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  41.86 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.91 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  43.18 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2149  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.8 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  46.51 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>