More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1592 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  730    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  78.47 
 
 
354 aa  568  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  45.38 
 
 
354 aa  331  9e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  24.65 
 
 
356 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  26.09 
 
 
369 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  23.77 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
574 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  24.66 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2252  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 
565 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  20.17 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 
496 aa  63.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.25 
 
 
480 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
501 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  20.36 
 
 
344 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.24 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 
300 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.95 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.39 
 
 
397 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2900  Radical SAM domain protein  20.71 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  24.35 
 
 
491 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.77 
 
 
422 aa  59.7  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 
394 aa  59.7  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
347 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0177  radical SAM family protein  22.18 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.698116  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0058  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 
459 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.64 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0273592 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.12 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.34 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 
497 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  32 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.67 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  23.44 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.42 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  19.77 
 
 
298 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.73 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 
427 aa  56.6  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 
380 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.27 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.02 
 
 
338 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  21.03 
 
 
332 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  23.98 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 
399 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  24.83 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.63 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6446  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.77 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.928018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 
329 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1425  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.75 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6404  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.75 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.62 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1669  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.79 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  24.4 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  20.85 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.26 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.512935  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 
450 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  25.68 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.6 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4157  radical SAM superfamily protein  24.55 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.87 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 
364 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 
393 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 
323 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 
481 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>