More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0243 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0243  histidine kinase  100 
 
 		 413 aa  824    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.804109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1692  histidine kinase  59.9 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0979  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0234  ATP-binding region ATPase domain protein  52.35 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0746  histidine kinase  54.39 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0663  histidine kinase  42.48 
 
 		 432 aa  299  5e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.435845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  25.8 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  26.44 
 
 		 496 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  27.84 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  26.65 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  25.47 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  26.71 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.13 
 
 		 466 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  26.26 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  28.89 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  27.41 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  29.96 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  25.41 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  29.57 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  26.94 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  27.35 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 479 aa  99.8  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 509 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 469 aa  99.8  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 480 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  27.33 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 501 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 472 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  26.45 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  29.01 
 
 		 1070 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 		 461 aa  97.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  28.52 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  27.44 
 
 		 459 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 470 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  24.86 
 
 		 446 aa  96.7  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  25 
 
 		 508 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  28.47 
 
 		 1070 aa  96.7  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 454 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 487 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 438 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  25.97 
 
 		 438 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  29.26 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  27.84 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  27.18 
 
 		 471 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  28.48 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  27.16 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  25.1 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  24.32 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  25.46 
 
 		 497 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2754  histidine kinase  24.31 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  26.63 
 
 		 497 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 639 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 469 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.65 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 467 aa  94.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  25.89 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  25.23 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 469 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 469 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 471 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 460 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3608  sensor protein BasS/PmrB  26.32 
 
 		 355 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000312076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  23.88 
 
 		 473 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3742  sensor protein BasS/PmrB  26.32 
 
 		 355 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63160  PmrB: two-component regulator system signal sensor kinase PmrB  27.53 
 
 		 477 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>