More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0746 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0746  histidine kinase  100 
 
 
378 aa  764    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0243  histidine kinase  54.39 
 
 
413 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.804109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1692  histidine kinase  53.83 
 
 
402 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0979  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.67 
 
 
406 aa  367  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0234  ATP-binding region ATPase domain protein  52.81 
 
 
436 aa  339  4e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0663  histidine kinase  45.4 
 
 
432 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.435845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  25.67 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
467 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
462 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  27.99 
 
 
508 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 
458 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  23.34 
 
 
463 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  25 
 
 
501 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
477 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
477 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  24.92 
 
 
475 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
474 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
509 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  22.36 
 
 
489 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
445 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
518 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 
461 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  24.41 
 
 
817 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  22.02 
 
 
496 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
505 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
505 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3208  sensor protein vanSB  25.35 
 
 
447 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  24.24 
 
 
505 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  25 
 
 
495 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 
463 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 
435 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  24.09 
 
 
435 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
505 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 
471 aa  96.3  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 
463 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  27.39 
 
 
467 aa  96.3  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  23.91 
 
 
523 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  23.23 
 
 
472 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  23.64 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
474 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 
485 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  23.88 
 
 
474 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
474 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  22.67 
 
 
473 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  23.15 
 
 
449 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  25.99 
 
 
457 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  25 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  24.16 
 
 
455 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  22.33 
 
 
455 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1229  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
477 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.131746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  22.48 
 
 
462 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
476 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  24.13 
 
 
501 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  24.13 
 
 
501 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  24.13 
 
 
501 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  24.13 
 
 
501 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  23.67 
 
 
517 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  24.13 
 
 
501 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 
465 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 
465 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 
501 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.08 
 
 
455 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  20.96 
 
 
467 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3453  histidine kinase  28.28 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 
444 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.65 
 
 
455 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 
362 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  23.86 
 
 
499 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  24.58 
 
 
504 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
466 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  23.7 
 
 
475 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  23.7 
 
 
482 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  23.9 
 
 
464 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  23.82 
 
 
472 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
465 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  22.79 
 
 
439 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
487 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 
466 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  23.9 
 
 
464 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.09 
 
 
486 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 
515 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
454 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  23.3 
 
 
482 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  26.47 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
458 aa  90.9  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  26.64 
 
 
433 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.03 
 
 
478 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
438 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  23.3 
 
 
482 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  24.09 
 
 
466 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  23.13 
 
 
480 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  23.3 
 
 
482 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.08 
 
 
455 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
846 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  27.24 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
472 aa  90.1  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  24.91 
 
 
442 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 
515 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>