More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4783 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
404 aa  770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  44.16 
 
 
436 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 
416 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  43.47 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
395 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  49.5 
 
 
413 aa  249  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.46 
 
 
448 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  41.9 
 
 
400 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  50.65 
 
 
343 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  39.12 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.96 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
400 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  48.78 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  47.12 
 
 
389 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
362 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  46.06 
 
 
403 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
473 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  46.39 
 
 
405 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  40.35 
 
 
398 aa  206  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  46.15 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  39.5 
 
 
391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
483 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 
357 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  38.01 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
469 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 
435 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
378 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.68 
 
 
362 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
373 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  35.89 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
375 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  36.78 
 
 
343 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
469 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  34.76 
 
 
367 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  44.64 
 
 
382 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
470 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
487 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  34.16 
 
 
405 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
455 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.21 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.99 
 
 
466 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
459 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  35.34 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.33 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
498 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.76 
 
 
469 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
513 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  37.24 
 
 
478 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  35.89 
 
 
555 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34.34 
 
 
481 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.87 
 
 
469 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.33 
 
 
592 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
489 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
534 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  28.43 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  27.99 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  28.76 
 
 
436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  38.38 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  29.76 
 
 
448 aa  133  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
477 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  36.18 
 
 
499 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
438 aa  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.67 
 
 
477 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
436 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
457 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  34.9 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  35.74 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
490 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.31 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35.62 
 
 
501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
469 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
467 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
537 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  35.62 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  30.38 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.77 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  39.58 
 
 
583 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
466 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
473 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.77 
 
 
471 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
462 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
515 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
466 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
468 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
468 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>