More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0979 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0979  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
406 aa  809    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1692  histidine kinase  71.25 
 
 
402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00187821  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0243  histidine kinase  57 
 
 
413 aa  454  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.804109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0234  ATP-binding region ATPase domain protein  52.07 
 
 
436 aa  411  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0746  histidine kinase  51.8 
 
 
378 aa  369  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0663  histidine kinase  46 
 
 
432 aa  310  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.435845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
452 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  29.03 
 
 
497 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  26.94 
 
 
446 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
500 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
435 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
435 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  26.86 
 
 
459 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
479 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
454 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 
439 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
454 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  28.95 
 
 
457 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
436 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
454 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
467 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 
481 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 
472 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01883  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  27.24 
 
 
452 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000273191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01873  hypothetical protein  27.24 
 
 
452 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000189435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1683  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
452 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  24.1 
 
 
439 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
469 aa  96.3  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  27.55 
 
 
452 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
452 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2199  heavy metal sensor histidine kinase  27.55 
 
 
452 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1217  heavy metal sensor histidine kinase  27.55 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00057319  normal  0.58155 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  24.47 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  27.48 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.11 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  25.29 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
462 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  23.95 
 
 
462 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  27.55 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000246705  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  22.87 
 
 
496 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
471 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  24.45 
 
 
474 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  28.63 
 
 
471 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0704  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
490 aa  94  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.65645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
487 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
515 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
477 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  24.92 
 
 
501 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
474 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  25.39 
 
 
495 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
474 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
446 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 
467 aa  93.6  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  25.55 
 
 
477 aa  93.6  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
500 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 
478 aa  93.2  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
477 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  26.32 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
465 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 
469 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  25.89 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  24.58 
 
 
443 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  25.73 
 
 
473 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
446 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
517 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
515 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 
462 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
495 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  28.03 
 
 
475 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3333  histidine kinase  26.72 
 
 
468 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
455 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
462 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
446 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
443 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
443 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
443 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
515 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  26.49 
 
 
478 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
445 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  24.67 
 
 
497 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  26.41 
 
 
478 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  27.72 
 
 
473 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  22.33 
 
 
489 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
454 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
473 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
519 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  26.07 
 
 
515 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  25.08 
 
 
500 aa  90.1  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  28.89 
 
 
472 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  26.63 
 
 
464 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
450 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>