More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3218 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.32 
 
 
441 aa  874    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
441 aa  880    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.64 
 
 
445 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.13 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  52.51 
 
 
446 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  52.51 
 
 
446 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.92 
 
 
438 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.31 
 
 
448 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
456 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  47.51 
 
 
453 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  47.51 
 
 
453 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  47.13 
 
 
451 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  47.51 
 
 
453 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  46.92 
 
 
454 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  47.51 
 
 
453 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  47.51 
 
 
453 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 
450 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  47.51 
 
 
722 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  47.06 
 
 
453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  48.97 
 
 
457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.34 
 
 
451 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
456 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  41.1 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
461 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  35.5 
 
 
450 aa  213  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
449 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  33.99 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  32.02 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
451 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  31.94 
 
 
451 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  35.8 
 
 
440 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
461 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
448 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
441 aa  142  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  29.62 
 
 
438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  26.32 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  29.62 
 
 
438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  29.69 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  29.69 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  29.69 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  29.69 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  29.69 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  31.44 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  29.66 
 
 
438 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  29.08 
 
 
449 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  30.5 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  29.41 
 
 
442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
438 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
444 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
438 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  27.7 
 
 
464 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
438 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  28.92 
 
 
452 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
501 aa  123  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
454 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
487 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3294  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
432 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.83 
 
 
433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0852151  hitchhiker  0.00000251535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
450 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
449 aa  120  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  27.06 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  28.33 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  28.98 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
450 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28.08 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  31.11 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  30.12 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  31.91 
 
 
444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  30.86 
 
 
438 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
481 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
445 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
450 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  28.76 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  28.84 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  28.84 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  28.44 
 
 
459 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  29.11 
 
 
487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
458 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  27.35 
 
 
449 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>