67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_A0069 on replicon NC_009726
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  99.09 
 
 		 438 aa  890    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  100 
 
 		 438 aa  900    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  58.14 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  35.73 
 
 		 447 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  38.41 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  35.35 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  36.25 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  36.25 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  38.6 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  30.32 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  29.91 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  29.74 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  29.66 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  29.74 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  29.74 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  29.66 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  29.84 
 
 		 433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  30.2 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  30.2 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  25 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  28.24 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  21.83 
 
 		 483 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  21.83 
 
 		 483 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  21.83 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  21.83 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  27.06 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  26.72 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  27.06 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  26.37 
 
 		 431 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  26.72 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  26.72 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  26.72 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  27.06 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  26.87 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  21.97 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  21.97 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  21.97 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  26.67 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  27.31 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  27.31 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  27.31 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  29.31 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  23.7 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  24.15 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  21.98 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  28.17 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  21.37 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  22.9 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  26.11 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  21.27 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  21.81 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  28.86 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  28.18 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  23.33 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  24.44 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  27.62 
 
 		 313 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  32.48 
 
 		 223 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  20.83 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7550  hypothetical protein  23.48 
 
 		 468 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0539353 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  20.89 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  22.1 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  24.1 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  25.62 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  25.54 
 
 		 381 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  24.55 
 
 		 219 aa  46.6  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  28.93 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  23.7 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>