More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1088 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  99.45 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  35.39 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  31.67 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 188 aa  94.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 203 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  28.02 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  29.61 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  29.61 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  29.78 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  29.78 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  29.78 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  29.78 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  35.75 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  29.14 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  34.19 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.21 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 203 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  30.68 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.94 
 
 		 188 aa  84.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  31.61 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  30.72 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  32.1 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  29.19 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  29.78 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  28 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 222 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 222 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 222 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  27.43 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  27.43 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  26.63 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  27.43 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  27.43 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  27.43 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  27.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  26.92 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  27.43 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  26.44 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  29.09 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  27.46 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.45 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>