80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03770 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03770  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1192    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0846  TPR repeat-containing protein  40.03 
 
 		 593 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0363  Tetratricopeptide TPR_3  29.83 
 
 		 602 aa  223  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3505  hypothetical protein  28.62 
 
 		 602 aa  206  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.012069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5521  Tetratricopeptide repeat protein  28.29 
 
 		 607 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0375374  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3805  Tetratricopeptide domain protein  27.21 
 
 		 595 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00975228  normal  0.247571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1963  Tetratricopeptide TPR_4  28.63 
 
 		 607 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 878 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 		 1073 aa  56.2  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.86 
 
 		 832 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 441 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 441 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.47 
 
 		 810 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  26.4 
 
 		 321 aa  53.9  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 542 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.54 
 
 		 676 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 2262 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  25.18 
 
 		 258 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 423 aa  51.6  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 718 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.24 
 
 		 561 aa  50.4  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1069 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  20.95 
 
 		 235 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  23.43 
 
 		 594 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.24 
 
 		 561 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 649 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 649 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 		 465 aa  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1676 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 646 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 2262 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.46 
 
 		 725 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 3301 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  26.35 
 
 		 815 aa  48.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26.96 
 
 		 321 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  25.61 
 
 		 682 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 		 1252 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.15 
 
 		 466 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.69 
 
 		 622 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.36 
 
 		 875 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 		 1252 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 1034 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 		 2240 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 632 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63396  predicted protein  25.98 
 
 		 551 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 750 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 		 689 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.21 
 
 		 624 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.45 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 3145 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 594 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3871  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 196 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 217 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  25.56 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 639 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 		 892 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  21.08 
 
 		 626 aa  44.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  25.42 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 269 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.81 
 
 		 837 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.4 
 
 		 764 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  21.86 
 
 		 545 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  22.66 
 
 		 703 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 329 aa  44.3  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 627 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1005 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  21.98 
 
 		 587 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 700 aa  43.9  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 1402 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 486 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  21.08 
 
 		 979 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 288 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 465 aa  43.5  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  22.46 
 
 		 772 aa  43.5  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>