More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0349 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  29.44 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  31.56 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  29.84 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  29.27 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  26.88 
 
 		 253 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  29.92 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  28.51 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.74 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 319 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.93 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  27.17 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  27.17 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  27.17 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  27.17 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  26.8 
 
 		 282 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 282 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 271 aa  88.6  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 282 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  26.8 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  26.77 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  26.8 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  26.36 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  29.57 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  25.98 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.12 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  25.69 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  25.91 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  29.5 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  25.93 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  23.29 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0610  transcriptional regulator, IclR family  27.98 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  23.29 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  23.29 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.97 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  26.11 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>