124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0226 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  45.41 
 
 
237 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  45.61 
 
 
228 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  40.99 
 
 
225 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  40.09 
 
 
260 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  39.29 
 
 
225 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  37.87 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  46.85 
 
 
265 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  35.43 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  34.03 
 
 
238 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  48.48 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  35.35 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  39.3 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  35.4 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  36.73 
 
 
224 aa  98.2  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  32.04 
 
 
189 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  39.06 
 
 
167 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  34.04 
 
 
179 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  32.42 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  29.95 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  35.56 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  46.03 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  34.4 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  32.45 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  33.97 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.01 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  25.93 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  33.96 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  28.29 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  34.62 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  26.97 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  32.86 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  32.81 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  33.07 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  29.8 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  29.8 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.88 
 
 
221 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  32.89 
 
 
197 aa  59.3  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  25.13 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  31.16 
 
 
234 aa  58.2  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  27.49 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  42.59 
 
 
126 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  28.93 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  24.69 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  31.97 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  33.11 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.65 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  28.99 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  28.37 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  33.04 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  31.69 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.85 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  32.17 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  29.3 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  26.32 
 
 
247 aa  55.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  29.17 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  25.26 
 
 
259 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  31.97 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  28.76 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  27.7 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.05 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  28.03 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  29.51 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  30.23 
 
 
257 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  29.59 
 
 
222 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  27.73 
 
 
253 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  26.15 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  27.34 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.86 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  29.32 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  28.35 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  28.3 
 
 
281 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  28.82 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  28.21 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  25.9 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  27.78 
 
 
199 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  33.64 
 
 
255 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  28.76 
 
 
274 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  28.12 
 
 
255 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  29.87 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  30 
 
 
338 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  28.92 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  27.86 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  29.57 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  22.99 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  30.54 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  27.22 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  26.7 
 
 
243 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  25.32 
 
 
237 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  34 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  26.79 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  23.58 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  24.04 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  27.44 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>