286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4313 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 278 aa  537  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  35.18 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  33.03 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  29.11 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 247 aa  85.5  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.3 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  30.73 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  31.22 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  29.87 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 244 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.95 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  26.85 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.91 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.39 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  25.58 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.85 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  23.28 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  30.9 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  29.8 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.98 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  28.45 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  26.19 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  29.33 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4222  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.31 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  27.47 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.02 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  24.02 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.02 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.02 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.02 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.02 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  24.19 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0338  extracellular solute-binding protein family 3  30.39 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000810551  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  24.73 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.02 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.91 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0133  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00116705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.6 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.62 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  23.62 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4005  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  26.92 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2702  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.49 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  24.58 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  22.28 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  24.15 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  23.29 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1454  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 389 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5167  extracellular solute-binding protein family 3  32.42 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  24.15 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  29.35 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.7 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.12 
 
 		 748 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1641  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0661  extracellular solute-binding protein family 3  27.68 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000289878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.61 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  29 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>