More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3889 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 286 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.72 
 
 		 290 aa  427  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.57 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.66 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.354327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59 
 
 		 287 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.71 
 
 		 286 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.972141 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.9 
 
 		 286 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 265 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000237313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 		 267 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1543  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.81 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.414706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  33.08 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  33.2 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  29.63 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  32.4 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  32.4 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  33.2 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  34.03 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1345  Ornithine carbamoyltransferase  33.87 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.593277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  30.28 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.53 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0526069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  31.14 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1906  putrescine transport system permease protein  32.03 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  30.68 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  30.68 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  30.68 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  30.68 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  31.43 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.83 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  27.91 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  27.91 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  27.91 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.097439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  27.91 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  27.69 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  27.91 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.76 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.2 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  30.15 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  33.33 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.45 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747095  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1764  ornithine carbamoyltransferase  31.47 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0922779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  33.06 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  33.06 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1055  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  31.47 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1298  putrescine ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2307  putrescine transport system permease protein  31.47 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2120  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  31.47 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.412651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2175  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  31.47 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0110  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  31.47 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1785  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  31.47 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1951  putrescine ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2279  putrescine ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  30.89 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4661  Ornithine carbamoyltransferase  32.23 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2017  putrescine transport system permease protein  31.45 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0631  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  31.45 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0937  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotI  31.82 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023039  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0723  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  31.45 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  29.53 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  30.5 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1064  ornithine carbamoyltransferase  31.08 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.607638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1134  ornithine carbamoyltransferase  30.28 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  30.89 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03960  polyamine transport protein PotI  29.67 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466236 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5047  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.36 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0808772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  30.17 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>