More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2127 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  79.46 
 
 		 346 aa  547  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0357  hypothetical protein  72.48 
 
 		 325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  57.89 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4478  hypothetical protein  57 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.23415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  55.59 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  55.27 
 
 		 336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3895  hypothetical protein  54 
 
 		 342 aa  318  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1693  hypothetical protein  52.36 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4438  hypothetical protein  53.36 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  50.84 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  45.03 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  43.11 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.75 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.47 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.11 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.11 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3010  twin-arginine translocation pathway signal  40.53 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.46 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  37.16 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2443  hypothetical protein  39.07 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.241679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.45 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.64 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  37.79 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  36.42 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.67 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3510  hypothetical protein  38 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  37.97 
 
 		 334 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  36.79 
 
 		 353 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.65 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.25 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.54 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  35.14 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.75 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  35.47 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.12 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.13 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.08 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.27 
 
 		 325 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.33 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.24 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.24 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.79 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  37.12 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  37.5 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  37.79 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  35.33 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  34.56 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.49 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.39 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.14 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  36.79 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  34.78 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.75 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.16 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  37.46 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  35.17 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  32.91 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.75 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  34.78 
 
 		 329 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36.7 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  36.15 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  38.03 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  35.58 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  36.7 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  35.45 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  35.2 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  36.88 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  34.97 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  35.57 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  32.23 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  35.1 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  32.78 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  35.88 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  35.45 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  35.74 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  35.76 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.93 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.33 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.45 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1967  hypothetical protein  35.47 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.59 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  33.8 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  34.85 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  35.86 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  34.24 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.2 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  33.24 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  38.1 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  32.67 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.62 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>