162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1084 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 326 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  71.43 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  66.17 
 
 		 334 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  61.18 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 		 317 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  42.39 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.69 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 		 331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  42.72 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  39.24 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  45.66 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.26 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  39.14 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  39.56 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40.66 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  40.45 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  42.06 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  39.81 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  40.41 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  39.27 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  31.65 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  28.29 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  28.71 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  32.06 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  31.03 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  31.06 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  34.84 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  34.84 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  34.84 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  34.43 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  34.43 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  29.66 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  24.29 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  30.08 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  27.53 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  30.63 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  27.81 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  24.83 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  24.38 
 
 		 208 aa  53.5  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  25 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  29.01 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  28.87 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  31.39 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  22.22 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  24.22 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  22.22 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  22.22 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  24.57 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  29.29 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  36.45 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  25.52 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  23.46 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  31.45 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  25.71 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  22.73 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  23.64 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  23.64 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  23.64 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  23.64 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  23.64 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  23.64 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  23.64 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  26.2 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  23.64 
 
 		 285 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  30.88 
 
 		 233 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  25.91 
 
 		 261 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.56 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  28.87 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  27.52 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  37.68 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  23.46 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  27.56 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  27.82 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  24.63 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  29.06 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  30.16 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  24.57 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  24.63 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  24.63 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  24.63 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  24.63 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  24.63 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  25 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>