134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5752 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  47.94 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.17 
 
 
216 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.27 
 
 
229 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.24 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.78 
 
 
208 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  35.68 
 
 
210 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  35.14 
 
 
210 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  36 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.05 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.59 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.81 
 
 
207 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.16 
 
 
207 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.33 
 
 
200 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  38.14 
 
 
148 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.53 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  29.26 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.27 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  28.89 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.89 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.6 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.93 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.12 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  27.37 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.37 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.29 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.1 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.23 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  29.2 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.28 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  24.18 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.68 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.08 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  27.69 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  25.28 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.74 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  28.42 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.32 
 
 
190 aa  52  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  22.35 
 
 
201 aa  51.6  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  28.8 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.39 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.73 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.05 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.78 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.72 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.51 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.05 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.48 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  26.72 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.72 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  29.51 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.05 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.05 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.42 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.21 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  24.55 
 
 
215 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  26.16 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.62 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.13 
 
 
247 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.68 
 
 
195 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.42 
 
 
220 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.55 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.61 
 
 
191 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  27.47 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.55 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.33 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  23.81 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.13 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.89 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.13 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.42 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  21.62 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  25.56 
 
 
192 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.08 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1968  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.24 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  23.42 
 
 
206 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  23.64 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.66 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.02 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.09 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  23.44 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.86 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.14 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.28 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  21.62 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.88 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.32 
 
 
383 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.79 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.55 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  23.64 
 
 
191 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.55 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.64 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.4 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.73 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.7 
 
 
1763 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.62 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.14 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>