78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  88.27 
 
 
196 aa  353  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  59.47 
 
 
194 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.41 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.15 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.14 
 
 
206 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  31.69 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.45 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.28 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.51 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.38 
 
 
207 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  30.43 
 
 
210 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  30.43 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.84 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.22 
 
 
212 aa  87.8  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.19 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.89 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.98 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.89 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.17 
 
 
204 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  33.9 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.02 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.03 
 
 
247 aa  51.6  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.83 
 
 
214 aa  51.2  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.13 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  25.41 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.53 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.2 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  30.61 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  26.61 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.42 
 
 
202 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  28.12 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.41 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.36 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.36 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  27.06 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.81 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  28.12 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.07 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  25.45 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.16 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.47 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.88 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  26.61 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  27.34 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  25.81 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  25.47 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.36 
 
 
195 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.85 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.47 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.32 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  26.67 
 
 
199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.76 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.53 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  25.81 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.69 
 
 
221 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.73 
 
 
188 aa  44.7  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  26.36 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.74 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.12 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2590  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.68 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.47 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  28.74 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.44 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  26.83 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2766  response regulator  35.48 
 
 
198 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0580203 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.16 
 
 
229 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.74 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  21.33 
 
 
457 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.8 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  24.53 
 
 
457 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.47 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25 
 
 
196 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.74 
 
 
195 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.5 
 
 
206 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.5 
 
 
206 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.56 
 
 
192 aa  41.2  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>