112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3637 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  64.22 
 
 
216 aa  269  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.27 
 
 
216 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.18 
 
 
203 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  41.29 
 
 
210 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  41.29 
 
 
210 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  40 
 
 
212 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  40.82 
 
 
213 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.61 
 
 
208 aa  148  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.69 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.32 
 
 
206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.34 
 
 
207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.84 
 
 
207 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.89 
 
 
199 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.7 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  34.39 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  45.97 
 
 
148 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  33.15 
 
 
196 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.41 
 
 
194 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.49 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  30.32 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.17 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.9 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  31.9 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.9 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.79 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.95 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.04 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.44 
 
 
196 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.32 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.65 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.21 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.04 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  24.75 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.91 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.53 
 
 
194 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  26.38 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.13 
 
 
192 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.13 
 
 
195 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  25.77 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.27 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.34 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.47 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.87 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.18 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.28 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.28 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1141  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.13 
 
 
462 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.71 
 
 
195 aa  49.3  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.96 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  23.85 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  28.07 
 
 
189 aa  48.5  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.8 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.73 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.97 
 
 
205 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.08 
 
 
195 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.64 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.71 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  39.68 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  23.89 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.78 
 
 
430 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.49 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  27.97 
 
 
194 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.17 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.18 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.18 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.24 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.17 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.56 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  23.89 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.72 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.83 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.89 
 
 
192 aa  45.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.83 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.32 
 
 
193 aa  45.1  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  38.18 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.85 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.31 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05586  hypothetical protein  32.81 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0569  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.22 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000937079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  38.18 
 
 
191 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0664  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.37 
 
 
441 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.293281  normal  0.015345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.22 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.42 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  24.21 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  21.24 
 
 
191 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.43 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2662  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.79 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151243  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  24.31 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  26.14 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  24.64 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  22.31 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  27.46 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0419  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.48 
 
 
182 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.069314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001606  putative two-component response regulatory protein  31.25 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1538  ANTAR domain protein with unknown sensor  30 
 
 
429 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.585588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3201  hypothetical protein  26.67 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  22.31 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.16 
 
 
200 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>