87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1304 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  85.15 
 
 		 206 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  50.25 
 
 		 213 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48.45 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.92 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.5 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.69 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.94 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.71 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  36.56 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  37.1 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.05 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.41 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.87 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  36.41 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  35.14 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.55 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.16 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  36.36 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  28.57 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  29.89 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.42 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.7 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  25.42 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  31.03 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.97 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.21 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.12 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  27.19 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.41 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.7 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.15 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.12 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.52 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  23.16 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.61 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.66 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.87 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.41 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.71 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.21 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.42 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.89 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.93 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.32 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.66 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.17 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  27.59 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.69 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  23.21 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  23.58 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  20 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.77 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.58 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  22.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.73 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  26.13 
 
 		 426 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.13 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.46 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.58 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0995  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.14 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  21.14 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3809  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.25 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  21.95 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.08 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.85 
 
 		 191 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.73 
 
 		 198 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.58 
 
 		 229 aa  42  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05586  hypothetical protein  30.86 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.31 
 
 		 229 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.73 
 
 		 219 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  23.21 
 
 		 226 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.44 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.73 
 
 		 219 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.48 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.67 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.85 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.21 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.52 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>