102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0050 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  50.26 
 
 
213 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.45 
 
 
206 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.6 
 
 
206 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  43.37 
 
 
207 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  43.01 
 
 
207 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.43 
 
 
216 aa  140  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.89 
 
 
229 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.21 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.73 
 
 
208 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.33 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.7 
 
 
212 aa  111  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  34.57 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  34.57 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.64 
 
 
203 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.12 
 
 
194 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.04 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  28.27 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  27.89 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  38.6 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.46 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.11 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  29.35 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  27.17 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.09 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.17 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.57 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.03 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.64 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.21 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.56 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.82 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.17 
 
 
202 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.44 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.18 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  23.46 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  29.13 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.13 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.26 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.85 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.28 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.35 
 
 
195 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.7 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0995  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.83 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.09 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.72 
 
 
242 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.15 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.89 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.32 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  30.43 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.68 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.16 
 
 
198 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29 
 
 
198 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.68 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  24.35 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  42.59 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.68 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.53 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  23.68 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  24.56 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1708  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.08 
 
 
431 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.667897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.68 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  23.96 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  23.96 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.56 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  23.96 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  23.96 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  23.96 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  23.96 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  23.96 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.97 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.09 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  23.68 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.73 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.37 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.78 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  28.57 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  23.68 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.18 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01489  histidine kinase/response regulator hybrid protein  29.73 
 
 
83 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.73 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  25.45 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  25.81 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  25 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.68 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.53 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.83 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.81 
 
 
192 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.8 
 
 
202 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.68 
 
 
194 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.86 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  30.43 
 
 
191 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.24 
 
 
213 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>