131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1847 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.18 
 
 
229 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.92 
 
 
216 aa  168  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  41.05 
 
 
210 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  40.53 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.24 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.53 
 
 
212 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.42 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.94 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.53 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  36.6 
 
 
213 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.98 
 
 
207 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.98 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.01 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.64 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  32.28 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  32.28 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  38.84 
 
 
148 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.97 
 
 
194 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.21 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.09 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  30.05 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  31.48 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.78 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.86 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.1 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.5 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.77 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.91 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.13 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0419  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.36 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.069314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.36 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.04 
 
 
196 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.09 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.04 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.65 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.42 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  20.83 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.36 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  28.57 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  29.21 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.97 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  25.65 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.46 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.12 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  19.64 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  21.83 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  24.14 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.03 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.24 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  22.7 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.21 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  25.44 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.59 
 
 
205 aa  48.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.24 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  28.18 
 
 
187 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.45 
 
 
194 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.56 
 
 
201 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  24.64 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3201  hypothetical protein  24.56 
 
 
221 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2662  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.44 
 
 
221 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.52 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.42 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.11 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.14 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3279  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.63 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.56 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.33 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.2 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.84 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0970  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.63 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  29.74 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.1 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.92 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.42 
 
 
229 aa  45.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  29.74 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  29.74 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  29.74 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  29.74 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  29.74 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  29.74 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  29.74 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  25.17 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.28 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  23.42 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.6 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  23.81 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  43.18 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.92 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.6 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  23.4 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.75 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.27 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.75 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  23.08 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.92 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.071014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>