113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6673 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  36.55 
 
 
201 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.04 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  39.78 
 
 
199 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  38.67 
 
 
199 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.67 
 
 
199 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  28.26 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.4 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2662  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.14 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151243  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.65 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.11 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.73 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.24 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.68 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3201  hypothetical protein  32.04 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.69 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  26.2 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.23 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  31.88 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  32.14 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.5 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.53 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  23.28 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  23.28 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.07 
 
 
229 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.97 
 
 
214 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.39 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.43 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.43 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.43 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.75 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.88 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  31.94 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.32 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0209  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.9 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  28.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.71 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.51 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  27.03 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.47 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.71 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.99 
 
 
247 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  31.33 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.85 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  31.34 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.68 
 
 
202 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  30.77 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.9 
 
 
195 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  28.26 
 
 
215 aa  51.2  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  29.67 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.16 
 
 
206 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  28.7 
 
 
148 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.03 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  30.22 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.68 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.48 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.67 
 
 
214 aa  48.9  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  24.83 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  29.66 
 
 
204 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.94 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.21 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.21 
 
 
191 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.37 
 
 
197 aa  47.8  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.28 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.28 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.14 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.9 
 
 
199 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.24 
 
 
198 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.97 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.59 
 
 
191 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.47 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.45 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  25.36 
 
 
198 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.69 
 
 
229 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.43 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.52 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  24.32 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  24.32 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  24.14 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  27.08 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.52 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.28 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.43 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.28 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.52 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.99 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.91 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.03 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.52 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.97 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  27.32 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.97 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.48 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.69 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.82 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.6 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>