58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4420 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  58.13 
 
 		 207 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  57.64 
 
 		 207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  49.25 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.21 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.49 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.04 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  35.11 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  34.57 
 
 		 210 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.63 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.91 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.89 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.93 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.81 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  32.45 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  30.98 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.94 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  30.37 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.28 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  31.91 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.91 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.38 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.96 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2662  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.98 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  26.97 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.31 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.07 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0419  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.069314  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.98 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.68 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3201  hypothetical protein  28.65 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.17 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.18 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.7 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.91 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  28.45 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001606  putative two-component response regulatory protein  32.18 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.46 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.91 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.52 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.52 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.93 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.26 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.93 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  22.45 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.3 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.77 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.53 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.11 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.3 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.55 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.22 
 
 		 197 aa  42  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  24.87 
 
 		 201 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.4 
 
 		 221 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0995  response regulator receiver and ANTAR domain protein  21.54 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>