35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3021 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2662  response regulator receiver and ANTAR domain protein  75.57 
 
 		 221 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3201  hypothetical protein  71.04 
 
 		 221 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  29.69 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.24 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  27.94 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.94 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.08 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.23 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.98 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  26.83 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.6 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.02 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  32.73 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  32.73 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.02 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.22 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.35 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.65 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  24.32 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.65 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.65 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  24.61 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  24.65 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0209  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.84 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.68 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  23.56 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.52 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.36 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.78 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2271  response regulator receiver domain-containing protein  22.35 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.64 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.32 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.86 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>