86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0209 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0209  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  28.33 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  28.02 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.78 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  21.71 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.9 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  28.65 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.21 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.38 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.83 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  31.41 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.95 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.03 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2662  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.03 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.86 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.28 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  27.33 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.72 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  29.51 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.72 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.27 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.15 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.91 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.83 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  27.17 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  25.2 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  25 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  26.52 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.58 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 1689 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.82 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.21 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  23.5 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.79 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.42 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.31 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  23.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  30.36 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  24.19 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  28.18 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3201  hypothetical protein  26.56 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  24.81 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.13 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  30.69 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  23.43 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.42 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  25.81 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0970  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3279  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5428  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.5 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.34 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  21.19 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  29.41 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.16 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  24.26 
 
 		 448 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.14 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.68 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3404  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 455 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235439  normal  0.675632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  30.68 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.04 
 
 		 561 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.5 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.91 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  24.27 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  29.79 
 
 		 130 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.06 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  19.46 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 534 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.03 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  37.14 
 
 		 988 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.77 
 
 		 206 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.77 
 
 		 206 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  37.14 
 
 		 1014 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  37.14 
 
 		 1032 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.12 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.71 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  28.18 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  20.53 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>