66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1767 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  88.27 
 
 		 196 aa  353  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  61.58 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.04 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.39 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.41 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  34.2 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.22 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.46 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.28 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.25 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  30.98 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  30.98 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.11 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.72 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.26 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.45 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.42 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.77 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  32.41 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.67 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  26.67 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  33.06 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.45 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.25 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.67 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  31.45 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.95 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  31.45 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  30.65 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.02 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.58 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.18 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.36 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.82 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.81 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.19 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  27.36 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.81 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.36 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  29.84 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  28.09 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.36 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  26.4 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  23.85 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.3 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.37 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.32 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.67 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.84 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  26.61 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  29.03 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.85 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.21 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.42 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2766  response regulator  37.63 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0580203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.67 
 
 		 194 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.13 
 
 		 194 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.09 
 
 		 208 aa  42  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2590  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.36 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.42 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.59 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>