83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0203 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0995  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.55 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.26 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.13 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.88 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  29.01 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.64 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.19 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.33 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.62 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.66 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.96 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.16 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.26 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.82 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  24.69 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.82 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  27.86 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  25.45 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.04 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.34 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.11 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  25.88 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.04 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.67 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  28.11 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.26 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  25.58 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.54 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.2 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  32.73 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0970  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.06 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  27.01 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.06 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3279  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.06 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  26.94 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.06 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.34 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.23 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  25.41 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.95 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.17 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.16 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  22.95 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  27.59 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.84 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  27.86 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.46 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.82 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.82 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.41 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.47 
 
 		 229 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0569  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.52 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000937079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.12 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  23.78 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.09 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.24 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.46 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.68 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.36 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.31 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  25.25 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  40 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.45 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.62 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.72 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.78 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.56 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  23.4 
 
 		 249 aa  45.1  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.11 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.78 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.73 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2910  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.34 
 
 		 426 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  19.86 
 
 		 203 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.35 
 
 		 206 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1968  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.84 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2600  two component transcriptional regulator  27.96 
 
 		 239 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0629  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.77 
 
 		 180 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2590  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.93 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.91 
 
 		 242 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03665  nitrate-and nitrite-responsive positive regulator  29.89 
 
 		 446 aa  41.6  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>