More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5642 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 361 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  33.63 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.18 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.56 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.14 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.42 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.29 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  29.28 
 
 		 407 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.87 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.67 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.67 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.17 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.67 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.55 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  22.8 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.77 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  24.46 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  22.77 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.95 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  28.7 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  21.39 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  23.03 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  23.94 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 438 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  24.12 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.24 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.86 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.24 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  27.86 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  22.08 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.24 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  20.86 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  21.95 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  21.95 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  22.94 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  25.61 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  20.86 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  22.94 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  22.94 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  22.94 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  22.94 
 
 		 373 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  25.61 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  20.59 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  20.59 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  26.19 
 
 		 350 aa  89.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  20.86 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  20.86 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  20.86 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  20.99 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.05 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  20.99 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  29.61 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  19.5 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  29.79 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  26.35 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  22.55 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  25.41 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  23.68 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  25.77 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  23.4 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  26.65 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.88 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  28.3 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  24.87 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  23.5 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  28.3 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  25.58 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  26.26 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  23.55 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  23.84 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  25.91 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  27.4 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  24.37 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.62 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  24.91 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  28.99 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  26.07 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  25.43 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  23.69 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  25.23 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  25.14 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  24.32 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>