230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2388 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  100 
 
 		 401 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  78.72 
 
 		 405 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  72.63 
 
 		 398 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  64.12 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  63.61 
 
 		 394 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  64.12 
 
 		 394 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  64.38 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  64.38 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  64.12 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  63.87 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  45.64 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  43.33 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  40.92 
 
 		 398 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  43.22 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  45.41 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  42.94 
 
 		 399 aa  286  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.78 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  44.5 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  41.48 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  42.82 
 
 		 395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  41.12 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  40.48 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  40.48 
 
 		 405 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  41.19 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  41.19 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  40.84 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  39.89 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  41.29 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  41.19 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  40.1 
 
 		 409 aa  259  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  40.52 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  38.3 
 
 		 376 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  36.23 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  39.53 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  31.68 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  32.04 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  30.79 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  30.79 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  30.79 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  30.79 
 
 		 416 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  30.53 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  30.58 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  31.22 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  30.81 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  30.47 
 
 		 421 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  31.89 
 
 		 414 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  31.99 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  31.72 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  34.75 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  33.33 
 
 		 464 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.1 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  31.13 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  30.87 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  31.22 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  30.95 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  30.95 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  30.95 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  30.95 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  30.69 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  32.19 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  29.87 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.93 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  28.82 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  28.77 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  30.9 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  33.6 
 
 		 432 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.38 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.64 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  30.37 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  31.87 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  33.15 
 
 		 436 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  30.02 
 
 		 426 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  30.17 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  31.53 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  30.17 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  30.17 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  26.94 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  30.05 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  30.61 
 
 		 426 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.75 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  32.27 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  29.08 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  31.71 
 
 		 426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  30.73 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  30.5 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.5 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  30.5 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  30.5 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  32.17 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  30.5 
 
 		 427 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  29.78 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  30.5 
 
 		 427 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  31.39 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  28.92 
 
 		 429 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  31.07 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  30.53 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  31.22 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>