More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1505 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 522 aa  1049    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  51.21 
 
 		 474 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  35.98 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 521 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  33.53 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  23.42 
 
 		 460 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 450 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 405 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  24.66 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  25.72 
 
 		 347 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 635 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  23.41 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  32.27 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 403 aa  100  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  29.28 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  37.28 
 
 		 1171 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 392 aa  98.2  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 439 aa  97.8  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  23.41 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 574 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 		 452 aa  95.1  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 649 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 698 aa  94  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 		 311 aa  93.2  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 		 331 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  34.12 
 
 		 308 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 		 320 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 647 aa  92  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 		 548 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 		 648 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 647 aa  92  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 545 aa  91.3  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 		 351 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 		 212 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.52 
 
 		 841 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  31.21 
 
 		 421 aa  91.3  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 177 aa  90.9  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  34.52 
 
 		 836 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  30.9 
 
 		 415 aa  90.9  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  34.46 
 
 		 740 aa  90.9  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 220 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  30.77 
 
 		 792 aa  89  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0230  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 383 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000415135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 531 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 359 aa  88.6  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 420 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 713 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35.33 
 
 		 619 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 770 aa  87.8  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 1335 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 		 1237 aa  87.8  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 417 aa  87.8  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  30.72 
 
 		 545 aa  87.4  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 		 364 aa  87  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 320 aa  86.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 		 508 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  32.75 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 		 615 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  28.74 
 
 		 760 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  36.77 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1513  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  32.95 
 
 		 848 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  25.09 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 718 aa  84.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 		 654 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>