64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6505 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 566 aa  1159    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  68.78 
 
 		 561 aa  810    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  66.37 
 
 		 561 aa  783    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  84.93 
 
 		 566 aa  1012    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  58.29 
 
 		 558 aa  687    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  71.05 
 
 		 562 aa  833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  57.04 
 
 		 556 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  69.57 
 
 		 561 aa  815    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  60.15 
 
 		 555 aa  692    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  54.76 
 
 		 549 aa  594  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  48.73 
 
 		 572 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.16 
 
 		 542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.45 
 
 		 548 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.64 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.45 
 
 		 548 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.82 
 
 		 548 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  40.25 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.82 
 
 		 543 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.68 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  38.61 
 
 		 566 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.3 
 
 		 567 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.89 
 
 		 567 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  39.26 
 
 		 567 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  39.44 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.53 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  35.85 
 
 		 582 aa  364  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.02 
 
 		 583 aa  364  3e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  38.68 
 
 		 565 aa  363  4e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  36.43 
 
 		 566 aa  360  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  37.45 
 
 		 566 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.32 
 
 		 570 aa  356  5e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  37.5 
 
 		 571 aa  356  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  37.45 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  38.27 
 
 		 578 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.07 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.22 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.64 
 
 		 570 aa  347  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  33.46 
 
 		 583 aa  346  8e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  32.65 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  36.56 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  36.96 
 
 		 570 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.7 
 
 		 566 aa  340  5e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.12 
 
 		 569 aa  332  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  45.9 
 
 		 425 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  47.54 
 
 		 425 aa  50.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  45.9 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  45.9 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  40.79 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  45.9 
 
 		 427 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  44.26 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  38.67 
 
 		 577 aa  47.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  44.78 
 
 		 572 aa  47.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  51.52 
 
 		 395 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  45.9 
 
 		 439 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  39.39 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  42.86 
 
 		 427 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  44.26 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  36.84 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35 
 
 		 432 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.62 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  41.67 
 
 		 431 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>