More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4750 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.51 
 
 
288 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  77.78 
 
 
288 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.67 
 
 
285 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.96 
 
 
285 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.73 
 
 
286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  68.07 
 
 
285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.79 
 
 
285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.31 
 
 
285 aa  401  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.2 
 
 
285 aa  401  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
285 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.84 
 
 
286 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.37 
 
 
285 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.84 
 
 
286 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.72 
 
 
285 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.49 
 
 
285 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.14 
 
 
285 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.38 
 
 
311 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.97 
 
 
286 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.49 
 
 
286 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.26 
 
 
285 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.21 
 
 
286 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.08 
 
 
292 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  65.37 
 
 
286 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.68 
 
 
300 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.89 
 
 
286 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.26 
 
 
285 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.54 
 
 
285 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.41 
 
 
285 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.19 
 
 
285 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.81 
 
 
280 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.85 
 
 
298 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.19 
 
 
285 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.78 
 
 
285 aa  358  6e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.19 
 
 
285 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.72 
 
 
288 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
290 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
290 aa  348  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0102101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
290 aa  348  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.42 
 
 
297 aa  341  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.54 
 
 
291 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.24 
 
 
292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.29 
 
 
298 aa  334  9e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.86 
 
 
295 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.86 
 
 
295 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.99 
 
 
285 aa  325  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
295 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.4 
 
 
293 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.66 
 
 
308 aa  319  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
293 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.78 
 
 
298 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
304 aa  311  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
284 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.15 
 
 
293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.61 
 
 
285 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  51.41 
 
 
286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.52 
 
 
285 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 
297 aa  298  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
286 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.35 
 
 
286 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
287 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 
288 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  50.52 
 
 
286 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.13 
 
 
306 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 
288 aa  292  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
285 aa  292  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  53.09 
 
 
297 aa  291  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 
284 aa  291  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 
288 aa  291  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  52.21 
 
 
288 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 
288 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  49.12 
 
 
291 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
284 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 
285 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 
287 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 
285 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 
285 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 
288 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 
288 aa  289  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 
288 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 
288 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  51.46 
 
 
288 aa  288  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.32 
 
 
333 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 
288 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  52.03 
 
 
288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.74 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.55 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.1 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  53.29 
 
 
313 aa  281  8.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170308  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.2 
 
 
285 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.78 
 
 
301 aa  281  9e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.2 
 
 
285 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.31 
 
 
299 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.5 
 
 
284 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0756  twin-arginine translocation pathway signal  52.98 
 
 
328 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.98 
 
 
328 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>