278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3025 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  100 
 
 		 375 aa  705    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  60.5 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  46.42 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  44.1 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  43.82 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  39.12 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  34.71 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  33.83 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  33.53 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  33.43 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  34.55 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  30 
 
 		 386 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  29.07 
 
 		 404 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  27.4 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  27.4 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  27.4 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  27.4 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  26.92 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  26.85 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  26.51 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  30 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  28.49 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  28.49 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  28.49 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  28.49 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 447 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 412 aa  95.9  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  25.66 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  28.09 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 446 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  27.79 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 426 aa  85.9  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  30.79 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>