More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  100 
 
 		 164 aa  327  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  77.44 
 
 		 168 aa  208  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  61.96 
 
 		 197 aa  207  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  66.07 
 
 		 202 aa  205  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  76.67 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  77.87 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  73.02 
 
 		 229 aa  194  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  74.19 
 
 		 178 aa  188  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  60.74 
 
 		 190 aa  187  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  69.7 
 
 		 169 aa  186  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  73.55 
 
 		 176 aa  186  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  72.88 
 
 		 190 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  65.22 
 
 		 176 aa  185  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  66.43 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  56.98 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  62.25 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  67.67 
 
 		 268 aa  178  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  70.59 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  60.24 
 
 		 196 aa  178  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  58.28 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  67.2 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  64.71 
 
 		 242 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  69.49 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  71.85 
 
 		 196 aa  174  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  62.86 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  69.83 
 
 		 222 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  61.48 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  61.48 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  61.48 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  72.44 
 
 		 190 aa  167  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  61.64 
 
 		 206 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  64 
 
 		 233 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  66.39 
 
 		 180 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  65.55 
 
 		 202 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  67.8 
 
 		 183 aa  156  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  61.25 
 
 		 195 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  55.45 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  47.37 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  50.44 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  50.79 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  51.3 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  58.42 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  55.45 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  42.38 
 
 		 140 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  41.72 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  44.87 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 208 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  48.25 
 
 		 247 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  51.85 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  57.41 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  42.28 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  40.76 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  55 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19700  ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00763987  normal  0.431624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  49.55 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  40.82 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 112 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  46.4 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0352  50S ribosomal protein L17  54.72 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2803  ribosomal protein L17  44 
 
 		 195 aa  110  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000866699  hitchhiker  0.000000348253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  44.68 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  43.33 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  40.54 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  47.86 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  45.76 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  47.06 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1979  50S ribosomal protein L17  53.77 
 
 		 116 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  42.07 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  46.22 
 
 		 140 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  48.65 
 
 		 113 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  48.65 
 
 		 113 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  43.38 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  45.38 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  43.38 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  45.38 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  41.5 
 
 		 138 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  51.33 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23271  50S ribosomal protein L17  51.89 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  50.94 
 
 		 116 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16541  50S ribosomal protein L17  53.77 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.173204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  49.07 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>