More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10240 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  100 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  46.64 
 
 
273 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  46.44 
 
 
273 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  46.07 
 
 
273 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  43.86 
 
 
294 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  44.53 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  40.73 
 
 
269 aa  195  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  39.43 
 
 
280 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  39.3 
 
 
279 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  40.44 
 
 
271 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  39.44 
 
 
283 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  37.09 
 
 
263 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  31.65 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  38.99 
 
 
276 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  37.46 
 
 
294 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  35.38 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  34.44 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  33.46 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
255 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  32.6 
 
 
255 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  31.67 
 
 
267 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  31.5 
 
 
255 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  31.5 
 
 
255 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  32.53 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  32.34 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  31.14 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  32.23 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  31.14 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  33.21 
 
 
264 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  31.99 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  32.03 
 
 
261 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  34.41 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
264 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  33.87 
 
 
268 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  34.15 
 
 
285 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  36.14 
 
 
281 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  36.32 
 
 
272 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  32.88 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
269 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  30.63 
 
 
309 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  30.53 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  31.37 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  30.53 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  26.72 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  26.72 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  32.38 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  30.85 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  30.85 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  27.2 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  32.21 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  26.03 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  32.21 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  30.85 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  26.18 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  29.88 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  30.85 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  30.17 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  30.32 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  31.9 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.95 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  30.04 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  29.03 
 
 
269 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.43 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 
273 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  29.7 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  30.35 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  44.71 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  26.89 
 
 
252 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  27.36 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  27.36 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  27.36 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.6 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  27.36 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  27.36 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  29.86 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  26.47 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>