More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2117 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2333  arginine utilization regulatory protein RocR  95.64 
 
 
461 aa  886    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2144  arginine utilization regulatory protein RocR  95.86 
 
 
461 aa  890    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.757971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2082  arginine utilization regulatory protein  95.86 
 
 
461 aa  890    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2078  arginine utilization regulatory protein  95.64 
 
 
461 aa  889    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2324  arginine utilization regulatory protein RocR  96.3 
 
 
459 aa  894    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1687  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  88.67 
 
 
461 aa  818    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2299  arginine utilization regulatory protein RocR  95.86 
 
 
461 aa  890    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2117  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  100 
 
 
459 aa  941    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3043  arginine utilization regulatory protein RocR  95.64 
 
 
477 aa  885    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.585344  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2407  arginine utilization regulatory protein RocR  95.64 
 
 
459 aa  885    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.830853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2280  arginine utilization regulatory protein RocR  95.21 
 
 
459 aa  884    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1165  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.13 
 
 
477 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.243116  hitchhiker  0.00329602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0545  arginine utilization regulatory protein RocR  42.32 
 
 
467 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.660554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0545  arginine utilization regulatory protein RocR  41.45 
 
 
467 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000949535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0464  arginine utilization regulatory protein RocR  41.67 
 
 
467 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0489  arginine utilization regulatory protein RocR  41.67 
 
 
467 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0494  arginine utilization regulatory protein RocR  41.67 
 
 
467 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0207155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0403  arginine utilization regulatory protein  41.23 
 
 
467 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0407  arginine utilization regulatory protein  41.01 
 
 
467 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00327881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1848  putative sigma54 specific transcriptional regulator  42.29 
 
 
424 aa  345  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0324  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.97 
 
 
487 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4828  arginine utilization regulatory protein RocR  41.1 
 
 
467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00181095  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0409  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.92 
 
 
467 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1727  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.09 
 
 
482 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0580  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.96 
 
 
494 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2712  putative regulatory protein  36.63 
 
 
475 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349156  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2603  putative regulatory protein  36.63 
 
 
475 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2549  putative regulatory protein  36.42 
 
 
475 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2591  putative regulatory protein  36.42 
 
 
475 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.43464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2503  putative regulatory protein  36.42 
 
 
475 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0314  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.35 
 
 
449 aa  316  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.85 
 
 
575 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06720  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.26 
 
 
581 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48830  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 
466 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000733273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4182  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
466 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00321886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  40.94 
 
 
662 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.38 
 
 
687 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0079  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.62 
 
 
564 aa  286  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.31 
 
 
585 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0978  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.93 
 
 
512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1041  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.22 
 
 
457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1802  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.1 
 
 
459 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0135454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2041  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.14 
 
 
455 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.94 
 
 
453 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.62 
 
 
453 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.34 
 
 
459 aa  276  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.44 
 
 
454 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0808  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.56 
 
 
591 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000794554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2710  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.13 
 
 
579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.51 
 
 
688 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1228  Fis family transcriptional regulator  46.23 
 
 
549 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1683  transcriptional regulator  38.58 
 
 
588 aa  272  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0451023  normal  0.0113335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2866  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.95 
 
 
703 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1748  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  47.08 
 
 
542 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0944  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.94 
 
 
480 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  36.26 
 
 
668 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  44.79 
 
 
684 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0961  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.69 
 
 
454 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.73 
 
 
582 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2055  transcriptional regulator  37.61 
 
 
600 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000658727  hitchhiker  0.000375363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1625  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  46.05 
 
 
544 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0165781  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0984  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.13 
 
 
455 aa  270  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0306  hypothetical protein  38.88 
 
 
582 aa  269  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2305  putative sigma54 specific transcriptional regulator  37.5 
 
 
601 aa  269  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.67 
 
 
480 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  35.82 
 
 
668 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1840  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.21 
 
 
456 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.33 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.8 
 
 
448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1785  NifA subfamily transcriptional regulator  42.01 
 
 
507 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.99 
 
 
483 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1326  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.99 
 
 
485 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2629  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.99 
 
 
483 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14604  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1750  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.4 
 
 
466 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1438  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.12 
 
 
592 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 
482 aa  266  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0489  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.43 
 
 
473 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1919  Fis family transcriptional regulator  45.55 
 
 
545 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0689  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  45.73 
 
 
544 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.430174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2035  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.22 
 
 
655 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1527  Fis family transcriptional regulator  46.05 
 
 
537 aa  265  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.36 
 
 
636 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0512499  normal  0.510149 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  35.99 
 
 
639 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  42.63 
 
 
495 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2018  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.27 
 
 
447 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0346  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.53 
 
 
468 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.143008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1505  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  46.02 
 
 
522 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.034794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.95 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156688  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  37.5 
 
 
586 aa  263  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.21 
 
 
448 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2109  Fis family transcriptional regulator  45.63 
 
 
473 aa  262  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2158  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.35 
 
 
453 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2099  Fis family transcriptional regulator  40.05 
 
 
574 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3238  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 
624 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.8 
 
 
576 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.535404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.77 
 
 
461 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.77 
 
 
461 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2816  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.58 
 
 
591 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0957  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.96 
 
 
690 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4277  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.96 
 
 
704 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>