More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2697 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2697  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  90.95 
 
 
210 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  90.95 
 
 
210 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4060  lysine exporter protein LysE/YggA  90.95 
 
 
210 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3461  lysine exporter protein LysE/YggA  90.48 
 
 
210 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  59.72 
 
 
212 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5879  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.35 
 
 
212 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2075  amino acid efflux pump, RhtB family protein  56.87 
 
 
212 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400632  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3295  lysine exporter protein LysE/YggA  47.32 
 
 
213 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  46.12 
 
 
212 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6091  lysine exporter protein LysE/YggA  43.9 
 
 
209 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0972486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1986  lysine exporter protein LysE/YggA  43.9 
 
 
209 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.39 
 
 
208 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128072  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.06 
 
 
204 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0418  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4336  RhtB family transporter  41.15 
 
 
212 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0857  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  0.0418461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.71 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2845  hypothetical protein  33.66 
 
 
209 aa  84.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85185  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0519  lysine exporter protein LysE/YggA  39.09 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.39 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  34.39 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.39 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  34.39 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  34.39 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  34.39 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  34.39 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  34.39 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  28.43 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  28.43 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7385  putative threonine efflux protein  31.75 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  28.43 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  28.43 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.85 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  30.54 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  31.19 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  25.4 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  25.4 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.19 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  25.13 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  25.13 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  25.13 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  25.13 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  25.4 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  29.47 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  25.4 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  29.47 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  29.47 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0858  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.74992  normal  0.0747821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  27.92 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.74 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  25.4 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  27.92 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.92 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  25.4 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  29.44 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.8 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  25.4 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.92 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  25.4 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  27.92 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  25.4 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  28.43 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08451  hypothetical protein  33.93 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.85 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  32.14 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28.43 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28.43 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  28.99 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  34.25 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  31.85 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  28.57 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  31.85 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  31.21 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  31.21 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.75 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  28.07 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  31.21 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.25 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  30.77 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  29.74 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  28.8 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.88 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.64 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.7 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>