More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4924 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  98.23 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  98.23 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  95.76 
 
 		 283 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  96.47 
 
 		 283 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  95.41 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  93.31 
 
 		 284 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  70.11 
 
 		 283 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 		 283 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  68.33 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  64.11 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  59.4 
 
 		 285 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  58.43 
 
 		 307 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  58.98 
 
 		 260 aa  321  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  44.91 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  44.53 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  28.41 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 277 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.97 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.78 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.52 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.94 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.54 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  30.97 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  26.92 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  32.23 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  25.18 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  37.4 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  37.4 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  24.26 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.34 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  21.38 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  27.03 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.03 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  24.19 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.18 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  22.38 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  27.31 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  37.39 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 562 aa  66.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  36.59 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.94 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.91 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  22.03 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  27.18 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  21.4 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  22.93 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.5 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  21.4 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  22.81 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>