128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1962 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 331 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  93.66 
 
 		 331 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  78.55 
 
 		 331 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  81.57 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  81.57 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  81.44 
 
 		 334 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  79.19 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  56.09 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  60.13 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.63 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  57.93 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  57.93 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  57.59 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  49.14 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  43.53 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  47.4 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.93 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  48.3 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  41.42 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.09 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.93 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  43.46 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1094 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.26 
 
 		 501 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.39 
 
 		 1148 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.35 
 
 		 493 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1181 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1224 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.95 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 		 1343 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  35.17 
 
 		 958 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.21 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.97 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.57 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.43 
 
 		 959 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.5 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.92 
 
 		 644 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.5 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.43 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.56 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  41.6 
 
 		 1133 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.73 
 
 		 1328 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.96 
 
 		 1438 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.06 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  29 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.84 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.65 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.05 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.16 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  27.86 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.04 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.99 
 
 		 192 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.48 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.54 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  34.62 
 
 		 886 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.73 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  35.36 
 
 		 773 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.9 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  44.26 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.8 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  32.78 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.3 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.73 
 
 		 176 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.69 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  29.38 
 
 		 643 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  33.8 
 
 		 2216 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.54 
 
 		 517 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.58 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.43 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.09 
 
 		 370 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.58 
 
 		 1139 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.33 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.6 
 
 		 524 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.65 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.02 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_002936  DET0219  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.88 
 
 		 164 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4484  heat domain-containing protein  31.4 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272856  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  27.65 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  23.95 
 
 		 541 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  27.1 
 
 		 1345 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.12 
 
 		 670 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.18 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.25 
 
 		 173 aa  49.3  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  27.87 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.17 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  37.04 
 
 		 838 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.95 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  23.76 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.76 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.33 
 
 		 846 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  33.33 
 
 		 381 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 		 1412 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.75 
 
 		 522 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.71 
 
 		 667 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 593 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.53 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>